近日，瑞典烏普薩拉大學聯(lián)合華大集團旗下深圳華大生命科學研究院、華大基因智惠醫(yī)學研究院對1063例結直腸癌樣本進行了全基因組及轉錄組測序分析，發(fā)現(xiàn)了一系列與癌癥不同階段相關的基因，并識別了結直腸癌關鍵預后因子，為結直腸癌的預防、治療及預后都提供了數(shù)據(jù)基礎，相關研究于8月7日發(fā)表于全球頂級學術期刊《自然》（Nature）。這也是目前全球最大的結直腸癌多組學研究。

Nature官網(wǎng)截圖。

基因信息+臨床數(shù)據(jù)，雙劍合璧破解“癌癥密碼”

為了加深對結直腸癌發(fā)病機制的理解，識別驅動事件并確定其預后特征，中瑞兩國科研團隊針對瑞典知名癌癥樣本與數(shù)據(jù)庫U-CAN隊列中的1063例結直腸癌樣本進行了全基因組和轉錄組測序分析。1063例樣本中包括782例結腸癌和281例直腸癌，其中，21%（223例）為微衛(wèi)星不穩(wěn)定腫瘤（結直腸癌中的一種特定類型）。

從測序結果中，研究團隊鑒定得到了96個顯著突變基因，其中有24個為新發(fā)現(xiàn)的潛在驅動基因；另外，研究人員還發(fā)現(xiàn)，與WNT, EGFR 和 TGF-β 通路相關的驅動基因，也與結直腸癌生存顯著相關。

不止如此，研究人員還利用突變時序分析，推導出了9個與癌癥發(fā)生早期事件相關的驅動突變基因，和更傾向于在癌癥發(fā)生的后期階段出現(xiàn)的突變基因。這些發(fā)現(xiàn)為結直腸癌的早期檢測和靶向治療的開發(fā)提供了臨床研究策略，并揭示了與腫瘤后期侵襲和轉移相關的重要分子變化。

本次分析的結直腸癌樣本中，94%的病人有完整的5年臨床隨訪記錄，這也為研究人員更好地將基因數(shù)據(jù)與臨床數(shù)據(jù)進行結合，破解“癌癥密碼”提供了可能。

既往對結直腸癌基因相關的研究主要集中在編碼區(qū)突變，但其實非編碼區(qū)也可能會對癌癥發(fā)生發(fā)展造成影響。

本研究中，研究人員通過全基因組和轉錄組測序分析發(fā)現(xiàn)在線粒體基因組和非編碼區(qū)域中也存在與疾病相關的突變，并對與疾病進展顯著相關的突變進行了系統(tǒng)性的總結，這些突破性的發(fā)現(xiàn)填補了非編碼區(qū)在結直腸癌相關研究中的空白，將進一步推動對結直腸癌發(fā)病機制的理解。

論文作者、烏普薩拉大學的Tobias Sj?blom教授表示：“這項研究實現(xiàn)了迄今為止最大規(guī)模的結直腸癌基因組和轉錄組的綜合分析，并將分子層面的發(fā)現(xiàn)與高質量的臨床數(shù)據(jù)相結合，從而識別關鍵預后因子，這使這項研究有別于其他絕大多數(shù)癌癥基因組學的研究。U-CAN大規(guī)模的臨床患者隊列與華大杰出的測序及數(shù)據(jù)分析能力相結合，對于本項目的成功至關重要，我們期待未來能在這一科學領域與華大持續(xù)合作。”

論文作者、華大基因智惠醫(yī)學研究院林從博士表示：“此次通過將華大先進的基因組學技術和數(shù)據(jù)分析資源應用于大規(guī)模結直腸癌人群，不僅發(fā)現(xiàn)多種突變事件對預后的顯著預測效應，新構建的表達譜精細分型也將在未來指導結直腸癌個體化診療中發(fā)揮重要作用。期望未來能更加系統(tǒng)深入地解析不同腫瘤的發(fā)生發(fā)展機制，利用華大前沿技術探索開發(fā)更具臨床應用價值的標志物，真正實現(xiàn)腫瘤的早診早治。”（俞洋）

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